40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4625 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  32.5 
 
 
411 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  30.79 
 
 
424 aa  116  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  30.17 
 
 
427 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  31.61 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  32.12 
 
 
372 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.16 
 
 
425 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  33.02 
 
 
426 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  27.51 
 
 
425 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  32.02 
 
 
407 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  33.59 
 
 
396 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  32.58 
 
 
406 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  31.12 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.08 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  27 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.08 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  31.91 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.71 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  28.06 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  30.96 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30.96 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  31.76 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  31.2 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.53 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  37.76 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  33.24 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  36.88 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  29.67 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.45 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.52 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.15 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  39.22 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  33.9 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  25.07 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.16 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.12 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  41.28 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.97 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>