More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2876 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
354 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5693  metal dependent phosphohydrolase  46.69 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0366  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.6 
 
 
358 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0917  metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  41.79 
 
 
350 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 
347 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.48 
 
 
364 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  41.83 
 
 
347 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
351 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1329  metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 
349 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
362 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  51.81 
 
 
360 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  37.22 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  51.6 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5466  hypothetical protein  40.84 
 
 
348 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5317  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  46.73 
 
 
388 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4706  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.49 
 
 
368 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
368 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  48.7 
 
 
385 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  48.19 
 
 
385 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
410 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 
399 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  36.24 
 
 
419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.91 
 
 
404 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  31.8 
 
 
401 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  45.07 
 
 
212 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
394 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
1237 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  36.87 
 
 
338 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  39.33 
 
 
649 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
651 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  40.36 
 
 
202 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
212 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  40.4 
 
 
308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
199 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 
718 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 
471 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  33.18 
 
 
409 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
412 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  41.72 
 
 
465 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 
650 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 
1313 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 
419 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
419 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 
1335 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.37 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
880 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
860 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  33.33 
 
 
395 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
311 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 
350 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  39.75 
 
 
719 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
402 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  34.57 
 
 
403 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  39.89 
 
 
1333 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
314 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  34.12 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2492  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
195 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
431 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  37.75 
 
 
414 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
411 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
304 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  39.74 
 
 
384 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
442 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  39.49 
 
 
405 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
247 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  35.07 
 
 
427 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
562 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.13 
 
 
1171 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
496 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 
505 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 
359 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
368 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
386 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
335 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
698 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
377 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
356 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  31.68 
 
 
740 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
328 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2713  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
370 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.409072  decreased coverage  0.0000724221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 
331 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>