216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1687 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
366 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  74.28 
 
 
370 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  73.22 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  72.65 
 
 
375 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  72.36 
 
 
375 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  60.33 
 
 
370 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  59.13 
 
 
367 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  64.39 
 
 
367 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  57.47 
 
 
357 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  56.32 
 
 
369 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  57.85 
 
 
413 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  55.22 
 
 
373 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  54.95 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  55.52 
 
 
412 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  55.36 
 
 
371 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 
371 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  53.3 
 
 
374 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  52.63 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  51.71 
 
 
373 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  50.93 
 
 
380 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  51.75 
 
 
378 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  50.93 
 
 
380 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 
373 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  51.96 
 
 
378 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  51.59 
 
 
373 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  52.02 
 
 
371 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 
371 aa  341  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  52.41 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 
378 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  50.82 
 
 
383 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  51.13 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 
376 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 
386 aa  322  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  46.49 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  48.66 
 
 
384 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 
365 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  47.38 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.61 
 
 
372 aa  309  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 
363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  45.95 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  48.35 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  44.66 
 
 
370 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  45.61 
 
 
398 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  46.87 
 
 
363 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  46.87 
 
 
363 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  45.87 
 
 
398 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  48.38 
 
 
380 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  46.3 
 
 
363 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 
367 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 
378 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  47.99 
 
 
365 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  45.07 
 
 
367 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
376 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  45.16 
 
 
367 aa  295  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  48.41 
 
 
401 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  45.41 
 
 
364 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 
370 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  45.48 
 
 
363 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 
374 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
369 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
369 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
363 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
363 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
363 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
363 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.88 
 
 
377 aa  288  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 
363 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  47.38 
 
 
386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 
371 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
363 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  45.16 
 
 
364 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
363 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 
367 aa  285  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  47.32 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  47.32 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.18 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  45.78 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  43.72 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  47.01 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 
368 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.95 
 
 
369 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  46.03 
 
 
365 aa  279  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  44.63 
 
 
368 aa  278  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  43.35 
 
 
363 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  45.5 
 
 
386 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 
367 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  44.08 
 
 
379 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  44.44 
 
 
370 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.7 
 
 
369 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 
373 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>