More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0188 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 535 aa  1058    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.6 
 
 		 523 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  42.64 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  41.22 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  41.44 
 
 		 601 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  39.54 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.55 
 
 		 225 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  34.23 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  33.77 
 
 		 491 aa  134  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  37.7 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  30.88 
 
 		 552 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.22 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  37.22 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 		 337 aa  114  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  33.33 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  30.16 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  30.19 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  30.16 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  33.24 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  28.98 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  29.13 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  29.47 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  30.64 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  29.82 
 
 		 326 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.52 
 
 		 326 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  27.87 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 		 335 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  31.6 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  28.42 
 
 		 325 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  31.76 
 
 		 798 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  26.69 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  31.76 
 
 		 798 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0355  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 		 791 aa  100  8e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  32.3 
 
 		 807 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 800 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 798 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 798 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  30.25 
 
 		 801 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  30.95 
 
 		 798 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 812 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  31.05 
 
 		 803 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 812 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  29.71 
 
 		 797 aa  98.2  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  31.23 
 
 		 798 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 784 aa  97.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  31.5 
 
 		 807 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 784 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  28.07 
 
 		 325 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 784 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 		 806 aa  96.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 788 aa  96.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 804 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  31.06 
 
 		 802 aa  96.3  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 823 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.65 
 
 		 784 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 		 806 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 784 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  29.54 
 
 		 785 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 		 806 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.64 
 
 		 808 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  29.54 
 
 		 783 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  30.74 
 
 		 807 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  30.29 
 
 		 835 aa  95.1  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  32.17 
 
 		 801 aa  95.1  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  32.27 
 
 		 812 aa  95.1  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 		 805 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  30.17 
 
 		 825 aa  94.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.07 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  29.54 
 
 		 785 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  29.54 
 
 		 785 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  29.54 
 
 		 785 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  29.75 
 
 		 805 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 798 aa  94.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 784 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.07 
 
 		 397 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.44 
 
 		 787 aa  94.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.07 
 
 		 441 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  30.86 
 
 		 810 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>