More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1897 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46.62 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  46.31 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.4 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 149 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 174 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 222 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  38.95 
 
 		 222 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  39.64 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  40.36 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  39.64 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  39.64 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  40.36 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.05 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.05 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.38 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.05 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.99 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.95 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  38.65 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>