More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0616 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 
428 aa  853    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
371 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  43.69 
 
 
394 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
396 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
374 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  33.24 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
388 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
388 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
386 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.94 
 
 
354 aa  121  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
418 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.4 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  38.79 
 
 
435 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
364 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  24.32 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  23.57 
 
 
359 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
669 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
890 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  23.57 
 
 
358 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
1264 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.85 
 
 
385 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
660 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
678 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
409 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.68 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
368 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.08 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.88 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  31.68 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
808 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.24 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
382 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
762 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
394 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.44 
 
 
352 aa  87  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 
356 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
392 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
379 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.8 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  23.72 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.3 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  22.94 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  28.42 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
363 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  20 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  22.22 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.17 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>