217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2419 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  54.45 
 
 
189 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  49.74 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  38.25 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
190 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  36.84 
 
 
191 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
191 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  37.37 
 
 
190 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
192 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
212 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
206 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
206 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
191 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
204 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
211 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
200 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
193 aa  108  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
210 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
204 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
199 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 
194 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
199 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 
193 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
211 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
207 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
193 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  33.15 
 
 
207 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 
193 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
194 aa  101  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
211 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  30.89 
 
 
194 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 
194 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
208 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
198 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
208 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  32.11 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
190 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  32.26 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
192 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
211 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28.72 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  37.11 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.07 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.38 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  40.48 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  32.59 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  35.77 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.33 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  31.85 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
224 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 
294 aa  61.6  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>