More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2170 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  55.11 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  57.61 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  52.59 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  51.52 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  49.27 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  52.09 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  50.57 
 
 		 285 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  47.35 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  46.99 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  44.69 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  45.74 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  45.52 
 
 		 333 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  37.26 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  41.33 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  37.41 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  41.05 
 
 		 285 aa  162  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  37.14 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  38.28 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  41.28 
 
 		 222 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.7 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  45.95 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 		 352 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  32.68 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  36.52 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  35.27 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 363 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.01 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  39.49 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  37.96 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.79 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  36.09 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.64 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.64 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 		 382 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 		 368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 		 368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.48 
 
 		 381 aa  128  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  46.94 
 
 		 362 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  33.56 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  33.06 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.59 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.5 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 		 369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  34.82 
 
 		 370 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  36.5 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 		 370 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  33.09 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  44.9 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.68 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.42 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  33.11 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  37.98 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 374 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.68 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  39.57 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  36.54 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3015  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  32.08 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2623  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  32.34 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  35.32 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  35.32 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  35.32 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.65 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  32.36 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  34.52 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  32.73 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 		 368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.86 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  36.27 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  35.29 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  34.57 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  33.6 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.08 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>