More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0717 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  58.04 
 
 
225 aa  277  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  44 
 
 
237 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  41.18 
 
 
235 aa  154  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 
229 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 
229 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  37.39 
 
 
223 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  32.31 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  37.26 
 
 
229 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  36.32 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.72 
 
 
269 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
242 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  27.96 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  27.96 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.92 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  26.73 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  30.05 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  26.41 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.1 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  41 
 
 
474 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.32 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  26.44 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.04 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  28.34 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  31.53 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  24.5 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.92 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
404 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  28.95 
 
 
251 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  25.41 
 
 
363 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.2 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.5 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  36.54 
 
 
337 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  26.76 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.64 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.34 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  32.69 
 
 
1287 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.41 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.26 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.26 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  28.26 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  28.26 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  28.26 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.64 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  23.31 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  22.86 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  31.43 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.9 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  21.43 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.41 
 
 
292 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
361 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.41 
 
 
292 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  33.98 
 
 
345 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  23.38 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  23.38 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  23.38 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  23.38 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.96 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.67 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  31.3 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 
352 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  25.29 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  23.38 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  22.58 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6252  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  27.89 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
348 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
346 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  23.37 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  24.51 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  29.22 
 
 
343 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  25.38 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  27.53 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 
314 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.05 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.29 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.38 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.97 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>