More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7951 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7951  inner-membrane translocator  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  32.17 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3773  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0402926  hitchhiker  0.00264869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2267  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0641115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.52 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  26.44 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4481  inner-membrane translocator  32 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  29.18 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2016  inner-membrane translocator  22.34 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4887  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  26.85 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.94 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4424  inner-membrane translocator  27.41 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2495  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  27.3 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.799542  hitchhiker  0.00275887 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  27.11 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  23.86 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  26.76 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  23.9 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  25 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.33 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5095  inner-membrane translocator  26.79 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00123813  normal  0.0753948 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  25.4 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6411  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0041004  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6644  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.901736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.02 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6242  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  26.02 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  25.09 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.02 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.99 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.17 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.99 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.99 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  25.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03306  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  24.49 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5242  ABC transporter permease  30.46 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.157706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4774  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  23.78 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  25.77 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3655  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  28.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3158  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  23.96 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.25 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>