More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7477 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  92.28 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 246 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.16 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.26 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 225 aa  284  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.83 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  52.28 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.28 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.65 
 
 		 244 aa  269  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 236 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.92 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  44.64 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.92 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.03 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  44.03 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  44.12 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.7 
 
 		 384 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.86 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.8 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.81 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.67 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.13 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  42.86 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.86 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  40.52 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.52 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.52 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  41.45 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.86 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  41.09 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 299 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  38.36 
 
 		 317 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  41.92 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  36.64 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.86 
 
 		 244 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  35.42 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.53 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.66 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.27 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.07 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  34.03 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.52 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  32.86 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  35.57 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.9 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  35.16 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  33.7 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.39 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  28.22 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>