More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5204 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.99 
 
 		 1000 aa  1140    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 969 aa  1871    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  46.68 
 
 		 1035 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  46.48 
 
 		 1035 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 1138 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 1055 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 1192 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 1296 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 836 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 1191 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  42.61 
 
 		 1410 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 1149 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 841 aa  363  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  43.63 
 
 		 846 aa  362  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 1031 aa  361  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 1005 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 		 728 aa  355  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 853 aa  351  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 1188 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  39.34 
 
 		 1201 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 981 aa  340  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 846 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 523 aa  224  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 617 aa  218  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 844 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 717 aa  212  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 778 aa  209  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  38.66 
 
 		 773 aa  206  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 773 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 377 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 798 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 769 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  40.51 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 769 aa  201  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 911 aa  201  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 784 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 533 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 594 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 511 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 1046 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 505 aa  195  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 531 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  41.49 
 
 		 511 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  37.55 
 
 		 783 aa  195  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1352 aa  195  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  37.55 
 
 		 783 aa  195  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 763 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 530 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.91 
 
 		 823 aa  195  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  43.98 
 
 		 513 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 511 aa  194  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.98 
 
 		 532 aa  194  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.53 
 
 		 508 aa  194  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  41.91 
 
 		 511 aa  194  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 530 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 536 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 456 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 774 aa  189  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 882 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 512 aa  188  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.04 
 
 		 503 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 1255 aa  187  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1548 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 470 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1069 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 371 aa  185  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 513 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 704 aa  184  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 769 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 511 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  42.26 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  40 
 
 		 599 aa  183  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  42.26 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 502 aa  183  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 874 aa  182  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 468 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  39.15 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1068 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  37.4 
 
 		 470 aa  179  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 507 aa  179  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 784 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 562 aa  178  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 600 aa  178  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 786 aa  178  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 770 aa  177  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 583 aa  177  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  38.72 
 
 		 774 aa  177  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 484 aa  177  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 490 aa  177  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 866 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 775 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  37.98 
 
 		 288 aa  176  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 744 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 568 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>