More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3614 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.79 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  76.92 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 68 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  75.38 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0374  cold-shock DNA-binding domain protein  69.12 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2609  cold-shock protein, DNA-binding  70.97 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  70.15 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 68 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1960  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 		 70 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507319  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0244  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 69 aa  96.7  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  69.23 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1022  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.908302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  67.69 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1504  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  68.25 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  68.25 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49410  cold-shock protein  68.25 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000191939  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  68.25 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 71 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  65.15 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  66.15 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2354  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.71 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.895038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  69.23 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  60.61 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7468  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  71.43 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  66.67 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11700  Cold shock domain family protein  68.85 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0476912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  64.06 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4395  cold-shock DNA-binding protein  68.75 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  65.15 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 68 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  65.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 65 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>