More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2704 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
158 aa  333  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.13 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60.13 
 
 
240 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.96 
 
 
169 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.33 
 
 
168 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.41 
 
 
169 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.17 
 
 
160 aa  155  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.01 
 
 
174 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
158 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.52 
 
 
180 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  48.34 
 
 
166 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
166 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.7 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.7 
 
 
170 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.67 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.23 
 
 
180 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.68 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.03 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.05 
 
 
158 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.97 
 
 
169 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
171 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.87 
 
 
158 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.09 
 
 
119 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.76 
 
 
176 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 
174 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.37 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  37.5 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.16 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.03 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.22 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  33.33 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  30.91 
 
 
564 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.42 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.42 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.57 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.2 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  34.62 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.9 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.9 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.9 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.94 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.9 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.24 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  33.96 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.23 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.64 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.96 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.54 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.54 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.79 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  38.14 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.7 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.11 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.92 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  34.55 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.54 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  30.36 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.34 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  32.32 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  30.72 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.96 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.85 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.55 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  36.08 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.95 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.26 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.91 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.77 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  34.95 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  35.79 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.65 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.86 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  34.29 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  37.37 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  34 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.37 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.43 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.25 
 
 
482 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  30.15 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.03 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  33.33 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  35.19 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  34.62 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  37.38 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.77 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>