More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0946 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0946  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2316  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  56.12 
 
 		 298 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1345  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0348  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.425258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.42 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0246  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3957  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04893  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6449  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  32.26 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6156  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3368  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.47 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3327  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012854  Rleg_6443  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0733  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2385  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3606  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7121  transcriptional regulator LysR family  32.12 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0306023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5146  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.981039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3108  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  0.186906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1783  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.54 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1453  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0519  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1122  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0752  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2586  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0491  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  29.21 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3068  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.63 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0983  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  30 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0403  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.177749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2979  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4077  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2113  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4017  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3501  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.828341  normal  0.395337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1219  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2855  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5711  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.831574  normal  0.349345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2761  transcription regulator protein  31.56 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.56038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0785  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3358  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2058  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1994  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.576839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6398  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0491  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.65 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1431  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2267  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000460407  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4553  hypothetical protein  28.82 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  28.52 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1385  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.765137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6126  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2650  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3561  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4269  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0387  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4588  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.042937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1764  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0381  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1578  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0432  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1370  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.260069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0921  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4611  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5424  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3307  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273694  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
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NC_008751  Dvul_1672  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324341  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
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NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2809  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226254  normal  1 
 
 
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