More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0648 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  732    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  33.84 
 
 		 335 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09770  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0907  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2385  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  unclonable  0.0000372406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  32.38 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  30.63 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  30.46 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  30.7 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 332 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  28.98 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>