157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3474 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3474  cytochrome c, class I  100 
 
 		 138 aa  287  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  38.39 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3475  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4103  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1792  cytochrome c class I  30.89 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.587019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  32.79 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  34.15 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  34.34 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  36.73 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  32.32 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  34 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  32.32 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  33.03 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  32.65 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  33.59 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  28.8 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0705  cytochrome cy  32.63 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2360  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442911  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  34.23 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 474 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  37.36 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  32.99 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  34.41 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3443  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  30 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0803  cytochrome c family protein  33.94 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  31.73 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  30.93 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  32.65 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  32.97 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4231  glucose sorbosone dehydrogenase  37.36 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.496798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  30 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0296  cytochrome c2  29.79 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1940  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7056  cytochrome c  32.56 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  26.36 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  33.08 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3553  cytochrome c, class I  36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2631  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0100  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  31.97 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  34.41 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  31.97 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>