53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0439 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  90 
 
 		 371 aa  658    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  741    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  90.28 
 
 		 371 aa  655    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  70.47 
 
 		 373 aa  510  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  61.75 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  38.52 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  39.48 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  40.97 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 344 aa  212  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  36.58 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  37.59 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  34.45 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 353 aa  166  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 300 aa  159  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  26.95 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  23.89 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  31.55 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  20.93 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.42 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.4 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.87 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.4 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.93 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.49 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.49 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.49 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.93 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.53 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  24.75 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  24.19 
 
 		 859 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.68 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.77 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.09 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.17 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  28.06 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>