More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1562 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  95.58 
 
 
362 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  95.58 
 
 
362 aa  687    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
362 aa  717    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  78.18 
 
 
362 aa  569  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65 
 
 
360 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.97 
 
 
384 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.7 
 
 
381 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
378 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.33 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.74 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.78 
 
 
387 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
381 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.9 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.56 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.67 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.6 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.5 
 
 
379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.21 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.95 
 
 
379 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.78 
 
 
386 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.16 
 
 
379 aa  269  7e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.58 
 
 
384 aa  269  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.43 
 
 
377 aa  268  8e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
388 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
388 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.57 
 
 
382 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
388 aa  266  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  41.13 
 
 
361 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.26 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
386 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
386 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.6 
 
 
383 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.04 
 
 
386 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.13 
 
 
361 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
386 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.65 
 
 
385 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.79 
 
 
382 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.48 
 
 
389 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.04 
 
 
386 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
386 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.28 
 
 
387 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.86 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.3 
 
 
385 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.53 
 
 
378 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.11 
 
 
385 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.06 
 
 
384 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.32 
 
 
382 aa  256  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.9 
 
 
392 aa  255  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.14 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.4 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  45.66 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.9 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.06 
 
 
388 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.97 
 
 
391 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.37 
 
 
390 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.22 
 
 
382 aa  251  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  37.4 
 
 
383 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
388 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.24 
 
 
390 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.33 
 
 
389 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.33 
 
 
389 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.44 
 
 
387 aa  249  4e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.08 
 
 
391 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  37.17 
 
 
395 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.9 
 
 
389 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.56 
 
 
387 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.72 
 
 
386 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.56 
 
 
387 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  38.18 
 
 
388 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  35.33 
 
 
387 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.33 
 
 
387 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  37.73 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.92 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.17 
 
 
360 aa  246  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.79 
 
 
393 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.93 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  37.66 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.66 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.42 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.98 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.93 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.05 
 
 
387 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.05 
 
 
387 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.32 
 
 
392 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.05 
 
 
387 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.08 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.4 
 
 
386 aa  243  5e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.66 
 
 
388 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>