38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1383 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  96.31 
 
 		 407 aa  814    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  96.31 
 
 		 407 aa  811    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  81.57 
 
 		 407 aa  702    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  100 
 
 		 407 aa  839    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  65.68 
 
 		 580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  48.76 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  46.77 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  45.23 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  43.37 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  43.07 
 
 		 397 aa  315  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  41.88 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  41 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  40.4 
 
 		 484 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  41.88 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  40.66 
 
 		 456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  40.36 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  42.89 
 
 		 447 aa  292  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  40.51 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  40.2 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  38.54 
 
 		 416 aa  269  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  36.72 
 
 		 487 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  37.57 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  32.24 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  31.25 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  34.52 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 1000 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.87 
 
 		 744 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 1006 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 994 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 		 1162 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  21.85 
 
 		 747 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  20.45 
 
 		 749 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  20.45 
 
 		 749 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  21.72 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 580 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  22.84 
 
 		 695 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  23.53 
 
 		 361 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>