More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1633 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  95.66 
 
 		 369 aa  723    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  753    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  94.85 
 
 		 369 aa  719    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  78.65 
 
 		 372 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  60.38 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  44.85 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  46.56 
 
 		 368 aa  311  9e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  40.37 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  39.63 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  41.65 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 398 aa  256  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  40.6 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 495 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 430 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  26.59 
 
 		 529 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 435 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 1250 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.01 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 533 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 529 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  24.72 
 
 		 533 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  25.07 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.24 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.61 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.35 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.62 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.08 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  20.6 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  24.03 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0761  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.76 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.206717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.72 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.36 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.15 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1323  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.13 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0560356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  23.32 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.2 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.23 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0777  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.27 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.73 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  20.37 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1128  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.46 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12350  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.77 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.02 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2575  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.15 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.687203  normal  0.0756163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.58 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00629  isopentenyl-adenosine A37 tRNA methylthiolase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.194806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2965  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00048321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0684  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2984  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0755  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00437825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00620  hypothetical protein  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0708  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000784837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.02 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0715  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0824  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0729  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0788  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.18 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>