More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1057 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  92.8 
 
 		 264 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  79.55 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  57.83 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  36.17 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.07 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  31.53 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  32.41 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.87 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.15 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.7 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.57 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.56 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.68 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.68 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.68 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.68 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.8 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.69 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  32.65 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  27.91 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  31.51 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.82 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.39 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.71 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.85 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.28 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.43 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.46 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 490 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.95 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.95 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.19 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.32 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.39 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.65 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>