39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2675 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  610  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  38.75 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  37.54 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  37.01 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  32.69 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  32.16 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  35.8 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  26.26 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  30.86 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  30.06 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  29.44 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  34.38 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  33.72 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  26.62 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  33.13 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  29.48 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  32.37 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  30.49 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  32.75 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  32.74 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  27.65 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25.71 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  26.02 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  33.94 
 
 		 175 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  30.22 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  27.11 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  29.94 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  27.67 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  27.75 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  29.11 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  29.6 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  34.23 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  34.02 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>