More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1880 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
431 aa  849    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
429 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
430 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 
429 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.73 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  30.41 
 
 
432 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  30.65 
 
 
432 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  32.35 
 
 
440 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
412 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.57 
 
 
442 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
450 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
435 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
431 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181526  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
417 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
439 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1933  hypothetical protein  33.94 
 
 
423 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497125  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
430 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.022517 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.86 
 
 
194 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
305 aa  123  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.245383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
289 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  30.36 
 
 
316 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
299 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.17 
 
 
302 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
302 aa  100  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  32.94 
 
 
334 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.75 
 
 
329 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  32.67 
 
 
317 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  32.54 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  32.54 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  27.95 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
309 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  32.27 
 
 
317 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
318 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
295 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
294 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  34.4 
 
 
327 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
306 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  34.09 
 
 
328 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.4 
 
 
316 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.46 
 
 
316 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
330 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
320 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
298 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
328 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.2 
 
 
328 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
302 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
321 aa  89.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.06 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  26.69 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
328 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
326 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
318 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
294 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.64 
 
 
320 aa  86.7  8e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
312 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0425  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.35 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  29.57 
 
 
328 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
314 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  29.57 
 
 
328 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.05 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  31.08 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  27.83 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.62 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  33.63 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04340  hypothetical protein  27.59 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  31.76 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.07 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  31.56 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  31.28 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.72 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.49 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.85 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>