72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04370 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  100 
 
 		 349 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.49 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  51.27 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.25 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  49.68 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.81 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.17 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.67 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.63 
 
 		 323 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.68 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.37 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.67 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.5 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.17 
 
 		 310 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.74 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.13 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 237 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.06 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.5 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.88 
 
 		 236 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.04 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.44 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.86 
 
 		 234 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.2 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.45 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.9 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.07 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.4 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  28.4 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  28.4 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.43 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  28.92 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.43 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.22 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  40.2 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.88 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.97 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.5 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.59 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  34.56 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.08 
 
 		 193 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  30.07 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  31.17 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.54 
 
 		 190 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.38 
 
 		 191 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.27 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  36.73 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0312  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  34.27 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.790918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.22 
 
 		 247 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.14 
 
 		 192 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.27 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5085  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.97 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6129  protocatechuate 3,4-dioxygenase alpha subunit  27.22 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.04 
 
 		 271 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  34.58 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.28 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7079  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.94 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898388  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 280 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.29 
 
 		 220 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3728  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  33.58 
 
 		 205 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0615  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.35 
 
 		 255 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.07 
 
 		 234 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.18 
 
 		 228 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5942  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  29.34 
 
 		 203 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4209  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  31.45 
 
 		 204 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>