160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2005 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  100 
 
 
375 aa  752    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  39.64 
 
 
485 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.75 
 
 
637 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  35.25 
 
 
403 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 
622 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  31.96 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.04 
 
 
605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  34.23 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  35.25 
 
 
465 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  30.75 
 
 
606 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  30.75 
 
 
606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  34.17 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  30.75 
 
 
606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  32.4 
 
 
640 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.43 
 
 
633 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.73 
 
 
642 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  28.04 
 
 
624 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  35.02 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  32.78 
 
 
634 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
639 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
624 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  29.04 
 
 
629 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  29.87 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  31.48 
 
 
486 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.02 
 
 
629 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  30.08 
 
 
627 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
618 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.38 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  29.07 
 
 
633 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  27.62 
 
 
646 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 
663 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  31.44 
 
 
623 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 
625 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  27.55 
 
 
645 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 
629 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  29.58 
 
 
626 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 
625 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.98 
 
 
644 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.56 
 
 
626 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
623 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.67 
 
 
618 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  27.57 
 
 
641 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 
606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 
613 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  29.59 
 
 
625 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  23.5 
 
 
600 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  27.22 
 
 
609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2249  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.63 
 
 
350 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
635 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  27.5 
 
 
611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.59 
 
 
638 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  28.09 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28 
 
 
615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  28.34 
 
 
480 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
615 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  27.09 
 
 
647 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.86 
 
 
615 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  30.67 
 
 
481 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  31.83 
 
 
605 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 
629 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 
645 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 
615 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.89 
 
 
648 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.43 
 
 
604 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
620 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.36 
 
 
649 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.94 
 
 
614 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
615 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  28.93 
 
 
565 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.81 
 
 
615 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  27.95 
 
 
485 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.81 
 
 
615 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
615 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  26.5 
 
 
645 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 
615 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.81 
 
 
615 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  26.58 
 
 
645 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  25.91 
 
 
652 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  28.62 
 
 
351 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  28.21 
 
 
622 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  31.95 
 
 
615 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 
641 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 
620 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 
620 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 
612 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 
603 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.74 
 
 
636 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  26.13 
 
 
648 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.99 
 
 
637 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  24.93 
 
 
681 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  28.93 
 
 
608 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
625 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 
628 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.6 
 
 
485 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
620 aa  99.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.93 
 
 
625 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.73 
 
 
613 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.99 
 
 
639 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  29.1 
 
 
629 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  24.86 
 
 
643 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>