154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0738 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  100 
 
 		 403 aa  830    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  74.62 
 
 		 465 aa  620  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  69.63 
 
 		 409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  68.27 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  68.27 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  59.55 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0974  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.5 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  35.25 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.8 
 
 		 633 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 613 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0517  hypothetical protein  27.84 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 618 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  30.18 
 
 		 624 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.93 
 
 		 637 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.86 
 
 		 600 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 606 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.17 
 
 		 606 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 623 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.03 
 
 		 642 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 		 634 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  31.82 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.87 
 
 		 613 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  28.11 
 
 		 615 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.13 
 
 		 644 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.92 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.66 
 
 		 649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3030  hypothetical protein  27.92 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  28.11 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 		 606 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 		 625 aa  116  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  29.29 
 
 		 629 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 649 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.99 
 
 		 485 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.6 
 
 		 629 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.53 
 
 		 650 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.63 
 
 		 660 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.56 
 
 		 604 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2703  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.15 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000043685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  27.85 
 
 		 622 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 		 624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 629 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.39 
 
 		 615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.18 
 
 		 629 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  25.5 
 
 		 603 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 625 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  30.8 
 
 		 641 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.3 
 
 		 601 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.19 
 
 		 639 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.46 
 
 		 626 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1513  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  28.24 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 618 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.64 
 
 		 625 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  27.6 
 
 		 615 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 		 640 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  26 
 
 		 627 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  26.73 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.44 
 
 		 605 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.59 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  28.39 
 
 		 638 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  23.02 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2249  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.53 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 		 615 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  25.57 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.25 
 
 		 626 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 		 620 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  26 
 
 		 641 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  23.59 
 
 		 622 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  27.8 
 
 		 610 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 		 615 aa  99.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 635 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 620 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.74 
 
 		 615 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.74 
 
 		 615 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 615 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  27.66 
 
 		 599 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25.74 
 
 		 615 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 620 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 620 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.42 
 
 		 603 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.85 
 
 		 601 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  24.39 
 
 		 614 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  27.36 
 
 		 576 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  24.42 
 
 		 645 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.91 
 
 		 648 aa  94.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.36 
 
 		 605 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  25.54 
 
 		 615 aa  93.6  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  26.96 
 
 		 645 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 605 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  26.96 
 
 		 645 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.18 
 
 		 601 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 		 598 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 645 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>