153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2249 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2249  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  100 
 
 
350 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 
641 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  33.46 
 
 
480 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.54 
 
 
633 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  31.42 
 
 
634 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  32 
 
 
481 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.21 
 
 
649 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  28.34 
 
 
646 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.65 
 
 
650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.58 
 
 
600 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.24 
 
 
478 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  29.97 
 
 
485 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  28.26 
 
 
629 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
606 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.7 
 
 
613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  28.27 
 
 
613 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.69 
 
 
606 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.71 
 
 
660 aa  109  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.92 
 
 
635 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
618 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  23.85 
 
 
625 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  23.46 
 
 
629 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.72 
 
 
626 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  30.31 
 
 
373 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 
615 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  29.18 
 
 
638 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.11 
 
 
642 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  29.63 
 
 
375 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
606 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  23.26 
 
 
628 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  27.51 
 
 
645 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
629 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  23.17 
 
 
629 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  24.66 
 
 
615 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.34 
 
 
615 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  28.31 
 
 
351 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  28.46 
 
 
486 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  24.32 
 
 
615 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  25.53 
 
 
403 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
663 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.97 
 
 
485 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  27.27 
 
 
608 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  24.38 
 
 
626 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  29.52 
 
 
646 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.03 
 
 
626 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  23.17 
 
 
629 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  23.97 
 
 
641 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.33 
 
 
615 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  24.5 
 
 
639 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.33 
 
 
615 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.33 
 
 
615 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.33 
 
 
615 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  24.66 
 
 
620 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  24.66 
 
 
620 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.25 
 
 
615 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.68 
 
 
618 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25 
 
 
620 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  23.74 
 
 
615 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.74 
 
 
624 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.91 
 
 
649 aa  99.8  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  24.65 
 
 
625 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  25.32 
 
 
561 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  24.75 
 
 
637 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  26.18 
 
 
465 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
620 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  27.57 
 
 
404 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.25 
 
 
648 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  26.09 
 
 
601 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.43 
 
 
636 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  24.44 
 
 
633 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  27.68 
 
 
609 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  26.94 
 
 
641 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.9 
 
 
605 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  23.89 
 
 
624 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  28.41 
 
 
643 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.29 
 
 
627 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.22 
 
 
648 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  26.82 
 
 
606 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  24.5 
 
 
607 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  24.72 
 
 
409 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.62 
 
 
604 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.87 
 
 
405 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  27.57 
 
 
645 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
645 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
645 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.29 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
608 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.04 
 
 
637 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  25.99 
 
 
623 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  29.14 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 
623 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.58 
 
 
605 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  29.14 
 
 
599 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  26.3 
 
 
640 aa  90.1  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
617 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.91 
 
 
605 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  25.97 
 
 
644 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  23.55 
 
 
622 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.84 
 
 
667 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>