158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1634 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  703    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  48.44 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  44.54 
 
 		 648 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  42.65 
 
 		 646 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  41.07 
 
 		 629 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  43.02 
 
 		 481 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  39.65 
 
 		 645 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  41.81 
 
 		 646 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  41.12 
 
 		 645 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  38.44 
 
 		 663 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  37.95 
 
 		 645 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  39.43 
 
 		 645 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  38.07 
 
 		 622 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  39.43 
 
 		 645 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  38.73 
 
 		 644 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  38.61 
 
 		 646 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  38.37 
 
 		 643 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.54 
 
 		 625 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  39.12 
 
 		 645 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 		 615 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 615 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 618 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.24 
 
 		 615 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  32.75 
 
 		 615 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 639 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  34.71 
 
 		 629 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.71 
 
 		 633 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  33.44 
 
 		 625 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  34.71 
 
 		 629 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 620 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  35.69 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  35.76 
 
 		 637 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  32.75 
 
 		 620 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  35.69 
 
 		 606 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.32 
 
 		 650 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  39.12 
 
 		 606 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 615 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 615 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  36.86 
 
 		 637 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  31.34 
 
 		 627 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 606 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 620 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 620 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 625 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.01 
 
 		 660 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.94 
 
 		 642 aa  170  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  33.13 
 
 		 618 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  36.1 
 
 		 626 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  30.33 
 
 		 626 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 		 624 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  34.71 
 
 		 629 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  32.67 
 
 		 626 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  30.05 
 
 		 641 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  37.37 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  36.98 
 
 		 623 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 635 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  33.24 
 
 		 601 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32.17 
 
 		 614 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  32.9 
 
 		 634 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.01 
 
 		 649 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 		 624 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.75 
 
 		 644 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 623 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  27.25 
 
 		 622 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.32 
 
 		 649 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 639 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  31.85 
 
 		 633 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  31.63 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 641 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.83 
 
 		 606 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.05 
 
 		 601 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.55 
 
 		 485 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.07 
 
 		 605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.41 
 
 		 601 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 		 641 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 		 603 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.67 
 
 		 613 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 628 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  28.37 
 
 		 648 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.66 
 
 		 603 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 603 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  31.44 
 
 		 611 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.95 
 
 		 603 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  32.36 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.87 
 
 		 636 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  33.24 
 
 		 574 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  30.69 
 
 		 625 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 596 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  30.65 
 
 		 615 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 625 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.76 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>