More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1394 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 392 aa  809    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  69.25 
 
 		 390 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  69.82 
 
 		 388 aa  552  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 		 391 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.28 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  59.29 
 
 		 405 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 391 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 395 aa  474  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0695  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  58.7 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  60.72 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0361  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  57.83 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  57.65 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0915  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  57.36 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 424 aa  461  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  58.25 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.84 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  55.61 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  59.28 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  56.41 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  58.84 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1588  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00363039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  56.25 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  56.49 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 402 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0371  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>