More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4354 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.72 
 
 
358 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.72 
 
 
358 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
358 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 
358 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
349 aa  242  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 
338 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.62 
 
 
357 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
347 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.62 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.77 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.77 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.77 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
347 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.86 
 
 
349 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
372 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
349 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 
350 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38 
 
 
354 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
351 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
365 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
374 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
330 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
589 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
326 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  26.04 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  27.78 
 
 
854 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  23.77 
 
 
661 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.67 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.48 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 
677 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
328 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.71 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 
694 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.32 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
849 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  30.46 
 
 
327 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  31.27 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.55 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.43 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.82 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>