34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2454 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  944    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.1 
 
 		 1035 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  28.52 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  27.56 
 
 		 954 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  28.66 
 
 		 1931 aa  74.3  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  28.31 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  27.67 
 
 		 919 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.29 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  28.71 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  27.02 
 
 		 777 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  28.32 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  26.49 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  32.19 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  25.82 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  26.47 
 
 		 724 aa  63.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  26.05 
 
 		 1056 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.05 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1121 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  26.9 
 
 		 749 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2225  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 681 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.297474 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  22.76 
 
 		 838 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.15 
 
 		 709 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  34.51 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.85 
 
 		 735 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  33.33 
 
 		 641 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.59 
 
 		 614 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  26.13 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  24.3 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  30.05 
 
 		 871 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  23.33 
 
 		 831 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.61 
 
 		 2272 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  41.43 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 805 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  35.8 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>