50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4854 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  85.21 
 
 
286 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
295 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  39.79 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  40.75 
 
 
289 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
311 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  36.77 
 
 
301 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  35.19 
 
 
290 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  58.82 
 
 
124 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  30.99 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  30.14 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  26.76 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  26.96 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  33.97 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  28.62 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  24.19 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.16 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.46 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  30.56 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.38 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  29.6 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.96 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  31.32 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.87 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  28.28 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.51 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  26.57 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  22 
 
 
291 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.75 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.06 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.77 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  25 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  20 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  21.52 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
170 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.52 
 
 
390 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  32.09 
 
 
133 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  32.74 
 
 
143 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>