More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4679 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  87.68 
 
 
203 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  68.97 
 
 
203 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  68.97 
 
 
203 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  68.97 
 
 
203 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  63.11 
 
 
228 aa  275  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 
202 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  46.35 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
200 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 
206 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  46.29 
 
 
191 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
194 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  45.11 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 
194 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 
223 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  42.27 
 
 
195 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 
198 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  41.3 
 
 
196 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  43.17 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 
210 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  42.37 
 
 
190 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  41.81 
 
 
200 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  37.02 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 
189 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  44.07 
 
 
194 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  44.2 
 
 
193 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  44.07 
 
 
193 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
244 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 
198 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  40.22 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  38.58 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  40.88 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  48.46 
 
 
178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  33.33 
 
 
239 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
212 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 
200 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  37.16 
 
 
236 aa  98.6  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  33.88 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.97 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.91 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.56 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
447 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.37 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.3 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  24.51 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.57 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
412 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.96 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  28.25 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.95 
 
 
442 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.52 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.73 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.67 
 
 
442 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.33 
 
 
442 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  24.02 
 
 
448 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.68 
 
 
442 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 
452 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  33.33 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.02 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.02 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.96 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
194 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>