More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4216 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
322 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  76.09 
 
 
320 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  69.88 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  69.88 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  69.88 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  66.45 
 
 
333 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  52.96 
 
 
315 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  52.83 
 
 
317 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  55.24 
 
 
322 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  49.85 
 
 
344 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  51.43 
 
 
318 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  52.32 
 
 
330 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  48.53 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  53.31 
 
 
375 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  52.38 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  54.08 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  52.56 
 
 
317 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  47.17 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  47.37 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  50.32 
 
 
341 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  47.48 
 
 
314 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  50 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  53.33 
 
 
317 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  50.62 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  47.6 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  51.61 
 
 
328 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  45.1 
 
 
361 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  42.62 
 
 
355 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  44.54 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  43.81 
 
 
341 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  53.87 
 
 
294 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  40.92 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.64 
 
 
327 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  40.36 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.31 
 
 
324 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  45.05 
 
 
335 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  41.16 
 
 
328 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  42.02 
 
 
327 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.37 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.15 
 
 
344 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  42.24 
 
 
323 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  40.19 
 
 
372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.03 
 
 
339 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  38.3 
 
 
329 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.39 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.02 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.49 
 
 
350 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 
337 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.27 
 
 
329 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  32.59 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
372 aa  132  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  34.88 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.23 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  28.71 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  36.07 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  33.21 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
336 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.53 
 
 
539 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 
355 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  35.9 
 
 
319 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 
318 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
325 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
344 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  34.13 
 
 
336 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.69 
 
 
337 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  35.76 
 
 
335 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 
315 aa  120  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
336 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 
329 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  38.83 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  37.41 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  35.87 
 
 
325 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 
329 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  37.32 
 
 
333 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  28.99 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  34.29 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  36.52 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  34.3 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.06 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  34.29 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.06 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  37.37 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
363 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>