77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2897 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  100 
 
 
426 aa  860    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  82.86 
 
 
430 aa  670    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  75.24 
 
 
430 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  72.98 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  72.38 
 
 
426 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  71.73 
 
 
436 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  68.74 
 
 
434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  68.57 
 
 
434 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  68.57 
 
 
434 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  62.71 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  62.71 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  83.92 
 
 
268 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  64.34 
 
 
411 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  65.92 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  65.92 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  59.04 
 
 
475 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  58.59 
 
 
424 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  72.78 
 
 
340 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  42.56 
 
 
547 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  42.39 
 
 
474 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  49 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  46.23 
 
 
479 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  47.09 
 
 
441 aa  279  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  44.21 
 
 
403 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  42.96 
 
 
404 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  44.36 
 
 
410 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  42.93 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  43.16 
 
 
405 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  42.47 
 
 
437 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  43.16 
 
 
408 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  41.35 
 
 
423 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  43.19 
 
 
404 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.5 
 
 
481 aa  193  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  32.1 
 
 
555 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  44.54 
 
 
256 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  30.3 
 
 
594 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  32.17 
 
 
545 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.66 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.25 
 
 
541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  29.5 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.89 
 
 
510 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.5 
 
 
426 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.49 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  24.89 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.09 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.74 
 
 
568 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.34 
 
 
551 aa  73.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  24.48 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.23 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.61 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.47 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.94 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.35 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.48 
 
 
530 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  25.68 
 
 
535 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.87 
 
 
748 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.25 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.42 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  26.45 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  26.71 
 
 
310 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  31.97 
 
 
714 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32.24 
 
 
443 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.79 
 
 
585 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.27 
 
 
580 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.3 
 
 
553 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  27.45 
 
 
567 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.09 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.09 
 
 
605 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.66 
 
 
584 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  26.7 
 
 
558 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  28.99 
 
 
222 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  27.07 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  24.93 
 
 
480 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.08 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.08 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  30.17 
 
 
603 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  47.5 
 
 
180 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>