More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1319 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  100 
 
 
370 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  79.18 
 
 
359 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  59.67 
 
 
375 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  61.11 
 
 
390 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  59.67 
 
 
375 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  59.67 
 
 
375 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  50 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  49.3 
 
 
369 aa  265  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  39.72 
 
 
363 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  33.41 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  35.98 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  30.67 
 
 
349 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  29.28 
 
 
388 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  28.9 
 
 
393 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.98 
 
 
393 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.54 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  27.48 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.27 
 
 
407 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.52 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.37 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.03 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.28 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  23.3 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.97 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.71 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.76 
 
 
664 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.03 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.83 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  21.01 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.28 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.71 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.33 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  30.81 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.08 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.88 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.63 
 
 
896 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.28 
 
 
644 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  26.86 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.96 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.16 
 
 
560 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.07 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  25.69 
 
 
626 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.89 
 
 
672 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.64 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  29.45 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.21 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.89 
 
 
674 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.34 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  24.31 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  24.34 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  30 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.48 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.94 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.94 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  28.37 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  24.89 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.94 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 
679 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.69 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  26.89 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.11 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.94 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.14 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  32.02 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  23.19 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.7 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.53 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.17 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.82 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  26.12 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.12 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  26.12 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.12 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.12 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  33.18 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.12 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  29.11 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.96 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  27.71 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.5 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.12 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  28.26 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.6 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  31.32 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  30.56 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.93 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  26.01 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.53 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  26.61 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.33 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  23.63 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  31.25 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.46 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.46 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  30.52 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.71 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.33 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>