217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0850 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  89.71 
 
 
201 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  85.29 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  85.29 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  85.29 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  85.28 
 
 
202 aa  343  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  65.62 
 
 
225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  58.42 
 
 
209 aa  240  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  51.89 
 
 
198 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  52.66 
 
 
193 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  51.63 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 
187 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  44.79 
 
 
193 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  44.26 
 
 
196 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  45.03 
 
 
192 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  43.96 
 
 
196 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  44.51 
 
 
196 aa  147  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  42.31 
 
 
208 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  41.71 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  41.54 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  44.62 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  40.88 
 
 
184 aa  131  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  41.71 
 
 
191 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  41.27 
 
 
192 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  41.85 
 
 
191 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  34.81 
 
 
182 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  31.75 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  28.04 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  29.53 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  29.63 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  30.22 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.26 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  31.1 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  33.85 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  28.04 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.12 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  31.55 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  29.17 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  28.73 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  28.18 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.23 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  26.09 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  27.37 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  26.63 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  28.82 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  27.92 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  27.71 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  23.24 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  27.27 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  28.81 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  27.27 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  28.43 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  30.61 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  29.8 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  31.37 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  30.37 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  29.73 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  26.74 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  29.73 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  29.73 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  30.67 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  28.04 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  30.46 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  27.81 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.03 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  31.82 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1827  hypothetical protein  31.49 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  30.86 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  29.12 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  30.57 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  29.33 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  27.49 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.03 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  27.1 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  28.09 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  27.49 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  28.34 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  28.09 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  26.9 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  27.17 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  28.95 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  27.66 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  28.41 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  26.7 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  26.88 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  27.93 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>