138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3275 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  98.99 
 
 
298 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  92.95 
 
 
298 aa  564  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  74.32 
 
 
300 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  72.54 
 
 
296 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  70.17 
 
 
296 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  56.62 
 
 
295 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  57.24 
 
 
295 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  61.17 
 
 
294 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  57.38 
 
 
321 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  59.11 
 
 
295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  58.48 
 
 
295 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  57.82 
 
 
295 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  56.85 
 
 
295 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  58.82 
 
 
296 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  58.82 
 
 
296 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  56 
 
 
295 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  61.71 
 
 
293 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  59.7 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  59.07 
 
 
293 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  55.18 
 
 
312 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  57.75 
 
 
298 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  55.28 
 
 
293 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  57.04 
 
 
296 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  55.75 
 
 
340 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  52.21 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  48.74 
 
 
297 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  47.54 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  46.07 
 
 
319 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  46.33 
 
 
286 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  45.59 
 
 
314 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  40.59 
 
 
286 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  40.29 
 
 
286 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  42.15 
 
 
287 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
285 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.44 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  40.21 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
297 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
297 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 
281 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  38.03 
 
 
296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  38.57 
 
 
310 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  39.39 
 
 
295 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  36.81 
 
 
286 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  39.08 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  38.04 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 
289 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 
301 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.95 
 
 
290 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  39.33 
 
 
312 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  39.33 
 
 
312 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  35.92 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  35.11 
 
 
299 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  35.52 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  35.52 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  35.52 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.52 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  35.52 
 
 
302 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.52 
 
 
302 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  36.47 
 
 
291 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  31.99 
 
 
285 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  32.34 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  32.65 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  33.61 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  29.29 
 
 
266 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  31.93 
 
 
266 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
266 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
266 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 
265 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.39 
 
 
277 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
265 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  30.29 
 
 
265 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 
267 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 
266 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  30.25 
 
 
266 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 
263 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
267 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  31.49 
 
 
274 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  29.88 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
265 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
270 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  32.65 
 
 
264 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
288 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.78 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>