More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0198 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0198  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 394 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.458254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0141  glycosyl transferase group 1  95.43 
 
 		 394 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0282  glycosyl transferase group 1  84.97 
 
 		 390 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 748 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.96 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.8 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.85 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.1 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  30.54 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 768 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  37.22 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.46 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.02 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.7 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.11 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.11 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.8 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.63 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.54 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.44 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  28.17 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  23.18 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.05 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.95 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.39 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2693  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>