32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4257 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 		 757 aa  1548    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  41.7 
 
 		 753 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.82 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.95 
 
 		 810 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  34.52 
 
 		 777 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.95 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.76 
 
 		 772 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  34.24 
 
 		 773 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.98 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  35.77 
 
 		 717 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  40.1 
 
 		 765 aa  359  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  33.51 
 
 		 753 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  34.92 
 
 		 691 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  32.57 
 
 		 705 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  29.79 
 
 		 670 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  30.36 
 
 		 541 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.43 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  25.74 
 
 		 614 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1589 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  20.68 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1627 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1744 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1781 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  25 
 
 		 1752 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  24.49 
 
 		 1389 aa  48.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  27.57 
 
 		 515 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  21.11 
 
 		 1005 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  30.22 
 
 		 503 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  25.74 
 
 		 565 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  22.66 
 
 		 556 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.58 
 
 		 509 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.25 
 
 		 448 aa  44.3  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>