More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4123 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  56.17 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.6 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  53.62 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  53.36 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  53.36 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  56.84 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  56.84 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  56.84 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.62 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  54.89 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.89 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  55.32 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.62 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  54.47 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  54.27 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  54.08 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  54.43 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.01 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  51.95 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.64 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  53.04 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  52.17 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  57.35 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.54 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  52.54 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  50.21 
 
 		 239 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  50.21 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  52.3 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  50.21 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  50.21 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  49.79 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  49.37 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  49.37 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  52.17 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  52.17 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  52.56 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  52.61 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  51.3 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  51.72 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  48.94 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  50.85 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  52.17 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  51.28 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  50.86 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  50.87 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.54 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  53.65 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.36 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  49.79 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  50 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>