More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3958 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.3 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000237313  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
286 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.972141 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
286 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.354327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
286 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
290 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
282 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  37.76 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  37.34 
 
 
256 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
286 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.2 
 
 
254 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
261 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  33.33 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.45 
 
 
264 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  29.35 
 
 
276 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
272 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.29 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  32.51 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  32.37 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.22 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  33.07 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  32.79 
 
 
273 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  30.65 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  31.52 
 
 
280 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  31.54 
 
 
266 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  32.47 
 
 
264 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
266 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  31.69 
 
 
272 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
266 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  30.74 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.28 
 
 
258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.414706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
272 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  29.96 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
266 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 
271 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  31.76 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.76 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.76 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.76 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  30.87 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.88 
 
 
273 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.48 
 
 
262 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 
267 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  29.67 
 
 
293 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
271 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.54 
 
 
281 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
267 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  28.97 
 
 
268 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
271 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  32.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
277 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  29.37 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  30.3 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  30.3 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  30.28 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  30.3 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  30.3 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  34.36 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5282  ABC transporter  32.52 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  32.14 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  28.97 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  34.36 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.44 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  31.44 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2284  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.73 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.408593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  31.44 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.44 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>