More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3188 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  75.22 
 
 
343 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  74.93 
 
 
343 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  74.93 
 
 
343 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  74.64 
 
 
343 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  73.68 
 
 
342 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  71.14 
 
 
343 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  67.64 
 
 
314 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  60.64 
 
 
342 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  62.03 
 
 
341 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  61.22 
 
 
343 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  61.16 
 
 
341 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  61.16 
 
 
342 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  59.48 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  63.19 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  61.74 
 
 
341 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
345 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  61.31 
 
 
337 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  60.12 
 
 
337 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  55.1 
 
 
337 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  58.04 
 
 
337 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  58.04 
 
 
337 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  56.76 
 
 
338 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  58.02 
 
 
337 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  58.02 
 
 
337 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48.39 
 
 
375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  45.41 
 
 
374 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  50.3 
 
 
329 aa  291  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  43.27 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  45.96 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  44.96 
 
 
348 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  42.35 
 
 
342 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  48.48 
 
 
525 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  48.05 
 
 
525 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  48.66 
 
 
463 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  46.32 
 
 
525 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  48.02 
 
 
648 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  51.61 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  45.12 
 
 
784 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  46.28 
 
 
799 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  32.26 
 
 
323 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
256 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  44.07 
 
 
266 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  37.06 
 
 
245 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 
257 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30 
 
 
289 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  27.5 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  42.98 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.02 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 
266 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
244 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  29.62 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
290 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 
246 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  39.84 
 
 
281 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  38.71 
 
 
179 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
272 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  43.22 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.67 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.14 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.89 
 
 
263 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 
259 aa  85.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  35.12 
 
 
224 aa  85.9  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  53.25 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  37.41 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  34.97 
 
 
212 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  28.06 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  36.5 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  35.66 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  35.65 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  37.88 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 
261 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  38.52 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.79 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  37.3 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  38.33 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  31.95 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>