48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1892 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  100 
 
 		 113 aa  236  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  56.36 
 
 		 116 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  55.36 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  53.64 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  51.82 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  45.22 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  50 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  47.56 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  41.86 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  39.82 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  50.72 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  38.94 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  38.94 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  49.3 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  40 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  39.51 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  41.67 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  39.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  37.66 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  45.07 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  45.59 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  42.11 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  32.29 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  43.08 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  32.22 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  36.99 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  35.37 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  61.29 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  37.14 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  33.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>