More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2484 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2484  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0426  Crp/Fnr family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 202 aa  311  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1015  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000202163  unclonable  0.0000000139192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1482  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.9 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.053801  hitchhiker  0.0000318932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1419  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  33.88 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.86 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  29.59 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.29 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.83 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.51 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.32 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28.72 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.23 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.09 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  29.51 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.42 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.15 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  30.43 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.46 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.42 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  29.76 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  31.74 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  29.57 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  29.76 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  29.41 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.18 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>