More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1602 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  84.58 
 
 
201 aa  354  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  67.21 
 
 
201 aa  269  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  52.74 
 
 
202 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.57 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.67 
 
 
217 aa  191  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.85 
 
 
201 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.4 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.27 
 
 
197 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.57 
 
 
211 aa  181  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.55 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 
197 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 
197 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  47.75 
 
 
204 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 
202 aa  175  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.78 
 
 
207 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.7 
 
 
203 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.03 
 
 
210 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.46 
 
 
206 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.19 
 
 
207 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.57 
 
 
214 aa  167  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.71 
 
 
206 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.94 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.26 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  45.66 
 
 
209 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.1 
 
 
212 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  42.41 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  37.89 
 
 
208 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  40.31 
 
 
201 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  38.69 
 
 
201 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  38.74 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  40.31 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  35.32 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  37.76 
 
 
201 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.51 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  38.38 
 
 
201 aa  131  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  39.79 
 
 
201 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  35.32 
 
 
200 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  39.79 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  39.79 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  38.95 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  38.95 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  38.95 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  35.5 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  44.51 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  38.51 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  38.95 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  39.27 
 
 
201 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  35.86 
 
 
200 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 
201 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  34.83 
 
 
200 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  39.27 
 
 
201 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  34.83 
 
 
200 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  34.33 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.35 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  36.65 
 
 
201 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 
200 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 
201 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  34.01 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  34.34 
 
 
200 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  36.6 
 
 
202 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.03 
 
 
198 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 
200 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  35.2 
 
 
201 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 
200 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.18 
 
 
196 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  42.76 
 
 
204 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  36.6 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  30.81 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  46.1 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.57 
 
 
204 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.57 
 
 
201 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  35.23 
 
 
201 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  35.53 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  42.68 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  35.05 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  38.37 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.07 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  34.2 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.89 
 
 
201 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>