More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1177 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  76.07 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  46.84 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2086  ribonuclease PH  45.92 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  47.03 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  48.4 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  48.18 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  44.1 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  44.35 
 
 		 257 aa  191  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  43.61 
 
 		 246 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  44.07 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  44.54 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  41.23 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  42.68 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  41.53 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  47.28 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  47.28 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  44.4 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  45.26 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  45.26 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  45.26 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  45.26 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  45.37 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0567  ribonuclease PH  48.54 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  45.57 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  44.83 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  43.46 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  46.35 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  44.49 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  44.8 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  40.87 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  40.87 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  43.11 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  45.34 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  43.93 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  41.67 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  42.62 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  43.88 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  45.18 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  43.88 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  41 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  41.26 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  45.89 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  45 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  43.53 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  43.97 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  43.97 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  43.97 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  44.07 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  43.88 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  43.53 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  47.57 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  47.57 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  46.15 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  41.3 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  47.09 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  46.15 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  43.72 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  41.18 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  43.22 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  46.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  43.53 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  43.88 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  43.53 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  42.79 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  44.07 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  45.73 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  48.33 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  40.25 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  43.64 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  45.73 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>