117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3061 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3061  CheW protein  100 
 
 		 166 aa  320  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2835  CheW domain-containing protein  99.4 
 
 		 195 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2953  CheW protein  87.13 
 
 		 192 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  56.12 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0240  CheW protein  51.3 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00382894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5449  CheW protein  50.97 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.470199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  34.16 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.24 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  29 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  27.69 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  23.39 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25.68 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.05 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.05 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  26.09 
 
 		 309 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  25.69 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  23.58 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.58 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  28.15 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  26.4 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  28.15 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  29.41 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.15 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  24.39 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  30.53 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  30.77 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  27.41 
 
 		 311 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  23.26 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  27.41 
 
 		 311 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  30.3 
 
 		 533 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.83 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.4 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  32.09 
 
 		 315 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  26.43 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.94 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.39 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  25.38 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  23.88 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  21.77 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  33.63 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.15 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  30.84 
 
 		 568 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  27.61 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  26.83 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.4 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  21.48 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  26.15 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  26.15 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  24.6 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  23.53 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.19 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.78 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  28.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  22.48 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.82 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  27.61 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  27.61 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  26.76 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.89 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  26.15 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  25.93 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  22.22 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  23.81 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  24.48 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  32.98 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  27.14 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  31.88 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  26.12 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.15 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  32.74 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  31.91 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  42.5 
 
 		 330 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  22.73 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  20.63 
 
 		 319 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 		 466 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  32.18 
 
 		 155 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  29.79 
 
 		 520 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.58 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.58 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  26.15 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  31.5 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  23.36 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  32.59 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32.08 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>