More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2715 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 		 361 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  48.87 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  49.15 
 
 		 363 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  47.04 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  48.84 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  45.98 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  45.98 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  47.97 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  46.67 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  43.82 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  44.77 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 376 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  43.5 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  40.67 
 
 		 367 aa  245  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  34.35 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  38.74 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  30.59 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  30.31 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  30.31 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  30.31 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  30.03 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  29.71 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  34.63 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  32.04 
 
 		 666 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  32.04 
 
 		 666 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  34.6 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  29.75 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  34.9 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  32.58 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  33.15 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.58 
 
 		 378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.73 
 
 		 652 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.07 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.6 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.85 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.6 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 401 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  32.1 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.67 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  33.62 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  31.6 
 
 		 652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  34.5 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.29 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.3 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.88 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.68 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.43 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  28.49 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.14 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.15 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.23 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  28.49 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  28.49 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.49 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  28.49 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.72 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.19 
 
 		 418 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 375 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  27.96 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  27.69 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  30.3 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.57 
 
 		 1033 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.06 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.19 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.26 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.73 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  28.45 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  27.59 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  26.62 
 
 		 439 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>